O protocolo de boas práticas agrícolas do GLOBALGAP é considerado um código de conduta, baseado nos seguintes critérios:

- Estabelecendo uma Gestão Ambiental que garanta a minimização dos seus impactos ambientais, incluindo o aproveitamento racional dos recursos naturais e garantindo um uso adequado de produtos químicos agropecuários;

- Estabelecendo uma Gestão Ocupacional, visando redução e controle dos perigos e riscos aos quais os trabalhadores rurais estão sujeitos.Estabelecendo uma Gestão da Qualidade do processo produtivo, garantindo a segurança dos alimentos produzidos;

- Produzindo conforme os princípios do APPCC (Análise de Perigos e Pontos Críticos de Controle) e da rastreabilidade dos alimentos;

- Propiciando instalações e manejo dos animais que visem o bem-estar dos animais.

Desta forma, a GLOBALGAP busca reduzir os riscos, assegurar a qualidade e inocuidade dos alimentos na produção, além de garantir a implementação das melhores práticas para uma produção sustentável, baseado nos documentos oficiais da GLOBALGAP, conforme segue:

Regulamento Geral versão 2.0 (março-2005).

Protocolo:
- Módulo 1 – para todas as fazendas
- Módulo 5 – base para animais
- Módulo 6 – bovinos e ovinos
- Módulo 7 – gado leiteiro
- Módulo 8 – suíno
- Módulo 9 – aves

Check-list:
- Módulo 1 – para todas as fazendas
- Módulo 5 – base para animais
- Módulo 6 – bovinos e ovinos
- Módulo 7 – gado leiteiro
- Módulo 8 – suíno
- Módulo 9 – aves